<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">tinro</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Известия ТИНРО</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Izvestiya TINRO</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1606-9919</issn><issn pub-type="epub">2658-5510</issn><publisher><publisher-name>ТИНРО</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.26428/1606-9919-2015-183-89-96</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">tinro-54</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>БИОЛОГИЧЕСКИЕ РЕСУРСЫ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>BIOLOGICAL RESOURCES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Генетическая дифференциация желтоперой камбалы ( Limanda  aspera) Тауйской губы, выявленная по нуклеотидным последовательностям фрагмента гена цитохрома b мтДНК</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Genetic differentiation of yellowfin sole ( Limanda aspera) from the Tauiskaya Guba Bay revealed on nucleotide sequences in fragment of the gene of cytochrome b mtDNA</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Пустовойт</surname><given-names>Сергей Павлович</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Pustovoit</surname><given-names>Sergey P.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">pustov@ibpn.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Юсупов</surname><given-names>Равиль Рашитович</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Yusupov</surname><given-names>Ravil R.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">yusupov@magniro.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>Институт биологических проблем Севера ДВО РАН</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-2"><institution>Магаданский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2015</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>30</day><month>12</month><year>2015</year></pub-date><volume>183</volume><issue>4</issue><fpage>89</fpage><lpage>96</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р., 2015</copyright-statement><copyright-year>2015</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Pustovoit S.P., Yusupov R.R.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://izvestiya.tinro-center.ru/jour/article/view/54">https://izvestiya.tinro-center.ru/jour/article/view/54</self-uri><abstract><p>Исследована генетическая дифференциация 6 выборок желтоперой камбалы, нерестующей в прибрежье Тауйской губы. В нуклеотидных последовательностях фрагмента гена цитохрома b у исследованных 150 особей обнаружено 57 гаплотипов. По величине генетической дифференциации выборок просматривается наличие восточной и западной группировок особей, коэффициент нуклеотидной дифференциации исследованных выборок NST = 0,0309. Обнаружение восточной и западной группировок нерестовых популяций указывает на необходимость дифференцированного подхода к определению величины промысла на отдельных участках Тауйской губы.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Genetic diversity of yellowfin sole from the northern Okhotsk Sea is considered for the first time. The genetic differentiation is investigated for six samples of this flounder species spawning in the Tauiskaya Guba Bay (159 specimens in total), and 57 haplotypes are revealed on nucleotide sequences in fragment of the gene of cytochrome b . Average haplotype diversity for all specimens is 0.870. Two groups of the flounders typical for the eastern and western parts of the bay could be divided by the value of genetic differentiation with the coefficient of nucleotide differentiation between them NST = 0.0309. This structure of the yellowfin sole spawning stock should be accounted in management of the flounders fishery in the Tauiskaya Guba Bay.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>желтоперая камбала</kwd><kwd>Охотское море</kwd><kwd>цитохром b</kwd><kwd>мтДНК</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>yellowfin sole</kwd><kwd>Okhotsk Sea</kwd><kwd>cytochrome b</kwd><kwd>mtDNA</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Дьяков Ю.П., Коваль Е.З., Богданов Л.З. Внутривидовой биохимический полиморфизм и популяционная структура черного палтуса Reinhardtius hippoglossoides (Walbaum) (Pleuronectidae) в Беринговом и Охотском морях // Вопр. ихтиол. - 1981. - Т. 21, вып. 5. - С. 809-815.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Дьяков Ю.П., Коваль Е.З., Богданов Л.З. Внутривидовой биохимический полиморфизм и популяционная структура черного палтуса Reinhardtius hippoglossoides (Walbaum) (Pleuronectidae) в Беринговом и Охотском морях // Вопр. ихтиол. - 1981. - Т. 21, вып. 5. - С. 809-815.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лакин Г.Ф. Биометрия : учеб. пособие для биол. спец. вузов. - М. : Высш. шк., 1990. - 352 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Лакин Г.Ф. Биометрия : учеб. пособие для биол. спец. вузов. - М. : Высш. шк., 1990. - 352 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О генетической дифференциации желтоперой камбалы Limanda aspera, обитающей в Тауйской губе, Охотское море // Цитология и генетика. - 2011. - Т. 45, № 3. - С. 57-62.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О генетической дифференциации желтоперой камбалы Limanda aspera, обитающей в Тауйской губе, Охотское море // Цитология и генетика. - 2011. - Т. 45, № 3. - С. 57-62.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О нуклеотидной последовательности гена цитохромоксидаза СО-1 митохондриальной ДНК желтоперой камбалы (Limanda aspera) Тауйской губы // Вестн. СВГУ. - 2012. - № 17. - С. 49-58.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О нуклеотидной последовательности гена цитохромоксидаза СО-1 митохондриальной ДНК желтоперой камбалы (Limanda aspera) Тауйской губы // Вестн. СВГУ. - 2012. - № 17. - С. 49-58.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р., Соловенчук Л.Л. и др. Полиморфизм фрагментов митохондриальной ДНК у желтоперой камбалы Limanda aspera, Pallas (1814) из Тауйской губы Охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. - 2014. - № 1. - С. 85-88.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р., Соловенчук Л.Л. и др. Полиморфизм фрагментов митохондриальной ДНК у желтоперой камбалы Limanda aspera, Pallas (1814) из Тауйской губы Охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. - 2014. - № 1. - С. 85-88.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Юсупов Р.Р. К вопросу дифференциации запаса желтоперой камбалы Limanda aspera (Pleuronectidae) северо-охотоморского промыслового района Охотского моря // Исслед. вод. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана : сб. науч. тр. - Петропавловск-Камчатский : КамчатНИРО, 2014. - Вып. 33. - С. 64-72.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Юсупов Р.Р. К вопросу дифференциации запаса желтоперой камбалы Limanda aspera (Pleuronectidae) северо-охотоморского промыслового района Охотского моря // Исслед. вод. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана : сб. науч. тр. - Петропавловск-Камчатский : КамчатНИРО, 2014. - Вып. 33. - С. 64-72.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Юсупов Р.Р. Плодовитость желтоперой камбалы северной части Охотского моря // Вопр. рыб-ва. - 2009. - Т. 10, № 2(38). - С. 284-291.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Юсупов Р.Р. Плодовитость желтоперой камбалы северной части Охотского моря // Вопр. рыб-ва. - 2009. - Т. 10, № 2(38). - С. 284-291.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bandelet H-J., Forster P., Rahl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Molecular Biology and Evolution. - 1999. - Vol. 16. - P. 37-48.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bandelet H-J., Forster P., Rahl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Molecular Biology and Evolution. - 1999. - Vol. 16. - P. 37-48.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Espineira M., Gonzalez-Lavin N., Vieites J.M., Santaclara F.J. Development of a method for the genetic identification of flatfish species on the basis of mitochondrial DNA sequences // J. of Agricultural and Food Chemistry. - 2008. - Vol. 56. - P. 8954-8961.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Espineira M., Gonzalez-Lavin N., Vieites J.M., Santaclara F.J. Development of a method for the genetic identification of flatfish species on the basis of mitochondrial DNA sequences // J. of Agricultural and Food Chemistry. - 2008. - Vol. 56. - P. 8954-8961.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Grant W.S., Bakkala R., Utter F.M. et al. Biochemical genetic population structure of yellow sole, Limanda aspera, of the North Pacific Ocean and Bering Sea // Fish. Bull. - 1983. - Vol. 81, № 4. - P. 667-677.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Grant W.S., Bakkala R., Utter F.M. et al. Biochemical genetic population structure of yellow sole, Limanda aspera, of the North Pacific Ocean and Bering Sea // Fish. Bull. - 1983. - Vol. 81, № 4. - P. 667-677.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Irwin D.M., Kocher T.D., Wilson A.C. Evolution of the cytochrome b gene of mammals // J. of Molecular Evolution. - 1991. - Vol. 32. - P. 128-144.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Irwin D.M., Kocher T.D., Wilson A.C. Evolution of the cytochrome b gene of mammals // J. of Molecular Evolution. - 1991. - Vol. 32. - P. 128-144.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kartavtsev Y.P., Park T.J., Vinnikov K.A. et al. Cytochrome b (Cyt b) gene sequence analysis in six flatfish species (Teleostei, Pleuronectidae), with phylogenetic and taxonomic insights // Mar. Biol. - 2007. - Vol. 152. - P. 757-773.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kartavtsev Y.P., Park T.J., Vinnikov K.A. et al. Cytochrome b (Cyt b) gene sequence analysis in six flatfish species (Teleostei, Pleuronectidae), with phylogenetic and taxonomic insights // Mar. Biol. - 2007. - Vol. 152. - P. 757-773.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kijewska A., Burzynski A., Wenne R. Molecular identification of European flounder (Platichthys flesus) and its hybrids with European plaice (Pleuronectes platessa) // ICES J. Mar. Sci. - 2009. - Vol. 66. - P. 902-906.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kijewska A., Burzynski A., Wenne R. Molecular identification of European flounder (Platichthys flesus) and its hybrids with European plaice (Pleuronectes platessa) // ICES J. Mar. Sci. - 2009. - Vol. 66. - P. 902-906.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Librado P., Rozas J. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data // Bioinformatics. - 2009. - Vol. 25, № 11. - P. 1451-1452.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Librado P., Rozas J. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data // Bioinformatics. - 2009. - Vol. 25, № 11. - P. 1451-1452.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mjelle K.A., Karlsen B.O., Jorgensen T.E. et al. Halibut mitochondrial genomes contain extensive heteroplasmic tandem repeat arrays involved in DNA recombination // BMC Genomics. - 2008. - Vol. 9, № 10. - P. 1-10.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mjelle K.A., Karlsen B.O., Jorgensen T.E. et al. Halibut mitochondrial genomes contain extensive heteroplasmic tandem repeat arrays involved in DNA recombination // BMC Genomics. - 2008. - Vol. 9, № 10. - P. 1-10.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Nei M., Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics. - Oxford : Oxford Univ. Press, 2000. - 333 p.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nei M., Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics. - Oxford : Oxford Univ. Press, 2000. - 333 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Nielsen J.L., Graziano S.L., Seitz A.C. Fine-scale population genetic structure in Alaskan Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis) // Conservation Genetics. - 2010. - Vol. 11, № 3. - P. 999-1012.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nielsen J.L., Graziano S.L., Seitz A.C. Fine-scale population genetic structure in Alaskan Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis) // Conservation Genetics. - 2010. - Vol. 11, № 3. - P. 999-1012.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sevilla R.G., Diez A., Noren M. et al. Primers and polymerase chain reaction conditions for DNA barcoding teleost fish based on the mitochondrial cytochrome b and nuclear rhodopsine genes // Mol. Ecol. Notes. - 2007. - Vol. 7. - P. 730-734.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sevilla R.G., Diez A., Noren M. et al. Primers and polymerase chain reaction conditions for DNA barcoding teleost fish based on the mitochondrial cytochrome b and nuclear rhodopsine genes // Mol. Ecol. Notes. - 2007. - Vol. 7. - P. 730-734.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetic Analysis version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - P. 2725-2729.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetic Analysis version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - P. 2725-2729.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Was A., Gosling E., Hoarau G. Microsatellite analysis of plaice (Pleuronectes platessa L.) in the NE Atlantic: weak genetic structuring in a milieu of high gene flow // Mar. Biol. - 2010. - Vol. 157, № 3. - P. 447-462.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Was A., Gosling E., Hoarau G. Microsatellite analysis of plaice (Pleuronectes platessa L.) in the NE Atlantic: weak genetic structuring in a milieu of high gene flow // Mar. Biol. - 2010. - Vol. 157, № 3. - P. 447-462.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
