Genetic differentiation of yellowfin sole ( Limanda aspera) from the Tauiskaya Guba Bay revealed on nucleotide sequences in fragment of the gene of cytochrome b mtDNA
https://doi.org/10.26428/1606-9919-2015-183-89-96
Abstract
Genetic diversity of yellowfin sole from the northern Okhotsk Sea is considered for the first time. The genetic differentiation is investigated for six samples of this flounder species spawning in the Tauiskaya Guba Bay (159 specimens in total), and 57 haplotypes are revealed on nucleotide sequences in fragment of the gene of cytochrome b . Average haplotype diversity for all specimens is 0.870. Two groups of the flounders typical for the eastern and western parts of the bay could be divided by the value of genetic differentiation with the coefficient of nucleotide differentiation between them NST = 0.0309. This structure of the yellowfin sole spawning stock should be accounted in management of the flounders fishery in the Tauiskaya Guba Bay.
About the Authors
Sergey P. Pustovoit
Институт биологических проблем Севера ДВО РАН
Russian Federation
Russian Federation
Ravil R. Yusupov
Магаданский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Дьяков Ю.П., Коваль Е.З., Богданов Л.З. Внутривидовой биохимический полиморфизм и популяционная структура черного палтуса Reinhardtius hippoglossoides (Walbaum) (Pleuronectidae) в Беринговом и Охотском морях // Вопр. ихтиол. - 1981. - Т. 21, вып. 5. - С. 809-815.
2. Лакин Г.Ф. Биометрия : учеб. пособие для биол. спец. вузов. - М. : Высш. шк., 1990. - 352 с.
3. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О генетической дифференциации желтоперой камбалы Limanda aspera, обитающей в Тауйской губе, Охотское море // Цитология и генетика. - 2011. - Т. 45, № 3. - С. 57-62.
4. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О нуклеотидной последовательности гена цитохромоксидаза СО-1 митохондриальной ДНК желтоперой камбалы (Limanda aspera) Тауйской губы // Вестн. СВГУ. - 2012. - № 17. - С. 49-58.
5. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р., Соловенчук Л.Л. и др. Полиморфизм фрагментов митохондриальной ДНК у желтоперой камбалы Limanda aspera, Pallas (1814) из Тауйской губы Охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. - 2014. - № 1. - С. 85-88.
6. Юсупов Р.Р. К вопросу дифференциации запаса желтоперой камбалы Limanda aspera (Pleuronectidae) северо-охотоморского промыслового района Охотского моря // Исслед. вод. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана : сб. науч. тр. - Петропавловск-Камчатский : КамчатНИРО, 2014. - Вып. 33. - С. 64-72.
7. Юсупов Р.Р. Плодовитость желтоперой камбалы северной части Охотского моря // Вопр. рыб-ва. - 2009. - Т. 10, № 2(38). - С. 284-291.
8. Bandelet H-J., Forster P., Rahl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Molecular Biology and Evolution. - 1999. - Vol. 16. - P. 37-48.
9. Espineira M., Gonzalez-Lavin N., Vieites J.M., Santaclara F.J. Development of a method for the genetic identification of flatfish species on the basis of mitochondrial DNA sequences // J. of Agricultural and Food Chemistry. - 2008. - Vol. 56. - P. 8954-8961.
10. Grant W.S., Bakkala R., Utter F.M. et al. Biochemical genetic population structure of yellow sole, Limanda aspera, of the North Pacific Ocean and Bering Sea // Fish. Bull. - 1983. - Vol. 81, № 4. - P. 667-677.
11. Irwin D.M., Kocher T.D., Wilson A.C. Evolution of the cytochrome b gene of mammals // J. of Molecular Evolution. - 1991. - Vol. 32. - P. 128-144.
12. Kartavtsev Y.P., Park T.J., Vinnikov K.A. et al. Cytochrome b (Cyt b) gene sequence analysis in six flatfish species (Teleostei, Pleuronectidae), with phylogenetic and taxonomic insights // Mar. Biol. - 2007. - Vol. 152. - P. 757-773.
13. Kijewska A., Burzynski A., Wenne R. Molecular identification of European flounder (Platichthys flesus) and its hybrids with European plaice (Pleuronectes platessa) // ICES J. Mar. Sci. - 2009. - Vol. 66. - P. 902-906.
14. Librado P., Rozas J. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data // Bioinformatics. - 2009. - Vol. 25, № 11. - P. 1451-1452.
15. Mjelle K.A., Karlsen B.O., Jorgensen T.E. et al. Halibut mitochondrial genomes contain extensive heteroplasmic tandem repeat arrays involved in DNA recombination // BMC Genomics. - 2008. - Vol. 9, № 10. - P. 1-10.
16. Nei M., Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics. - Oxford : Oxford Univ. Press, 2000. - 333 p.
17. Nielsen J.L., Graziano S.L., Seitz A.C. Fine-scale population genetic structure in Alaskan Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis) // Conservation Genetics. - 2010. - Vol. 11, № 3. - P. 999-1012.
18. Sevilla R.G., Diez A., Noren M. et al. Primers and polymerase chain reaction conditions for DNA barcoding teleost fish based on the mitochondrial cytochrome b and nuclear rhodopsine genes // Mol. Ecol. Notes. - 2007. - Vol. 7. - P. 730-734.
19. Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetic Analysis version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - P. 2725-2729.
20. Was A., Gosling E., Hoarau G. Microsatellite analysis of plaice (Pleuronectes platessa L.) in the NE Atlantic: weak genetic structuring in a milieu of high gene flow // Mar. Biol. - 2010. - Vol. 157, № 3. - P. 447-462.
Review
For citations:
Pustovoit S.P., Yusupov R.R. Genetic differentiation of yellowfin sole ( Limanda aspera) from the Tauiskaya Guba Bay revealed on nucleotide sequences in fragment of the gene of cytochrome b mtDNA. Izvestiya TINRO. 2015;183(4):89-96. (In Russ.) https://doi.org/10.26428/1606-9919-2015-183-89-96
Views:
450
Email this article 