Генетическая дифференциация желтоперой камбалы ( Limanda aspera) Тауйской губы, выявленная по нуклеотидным последовательностям фрагмента гена цитохрома b мтДНК
https://doi.org/10.26428/1606-9919-2015-183-89-96
Аннотация
Исследована генетическая дифференциация 6 выборок желтоперой камбалы, нерестующей в прибрежье Тауйской губы. В нуклеотидных последовательностях фрагмента гена цитохрома b у исследованных 150 особей обнаружено 57 гаплотипов. По величине генетической дифференциации выборок просматривается наличие восточной и западной группировок особей, коэффициент нуклеотидной дифференциации исследованных выборок NST = 0,0309. Обнаружение восточной и западной группировок нерестовых популяций указывает на необходимость дифференцированного подхода к определению величины промысла на отдельных участках Тауйской губы.
Об авторах
Сергей Павлович Пустовойт
Институт биологических проблем Севера ДВО РАН
Россия
Россия
Равиль Рашитович Юсупов
Магаданский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии
Россия
Россия
Список литературы
1. Дьяков Ю.П., Коваль Е.З., Богданов Л.З. Внутривидовой биохимический полиморфизм и популяционная структура черного палтуса Reinhardtius hippoglossoides (Walbaum) (Pleuronectidae) в Беринговом и Охотском морях // Вопр. ихтиол. - 1981. - Т. 21, вып. 5. - С. 809-815.
2. Лакин Г.Ф. Биометрия : учеб. пособие для биол. спец. вузов. - М. : Высш. шк., 1990. - 352 с.
3. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О генетической дифференциации желтоперой камбалы Limanda aspera, обитающей в Тауйской губе, Охотское море // Цитология и генетика. - 2011. - Т. 45, № 3. - С. 57-62.
4. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. О нуклеотидной последовательности гена цитохромоксидаза СО-1 митохондриальной ДНК желтоперой камбалы (Limanda aspera) Тауйской губы // Вестн. СВГУ. - 2012. - № 17. - С. 49-58.
5. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р., Соловенчук Л.Л. и др. Полиморфизм фрагментов митохондриальной ДНК у желтоперой камбалы Limanda aspera, Pallas (1814) из Тауйской губы Охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. - 2014. - № 1. - С. 85-88.
6. Юсупов Р.Р. К вопросу дифференциации запаса желтоперой камбалы Limanda aspera (Pleuronectidae) северо-охотоморского промыслового района Охотского моря // Исслед. вод. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана : сб. науч. тр. - Петропавловск-Камчатский : КамчатНИРО, 2014. - Вып. 33. - С. 64-72.
7. Юсупов Р.Р. Плодовитость желтоперой камбалы северной части Охотского моря // Вопр. рыб-ва. - 2009. - Т. 10, № 2(38). - С. 284-291.
8. Bandelet H-J., Forster P., Rahl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Molecular Biology and Evolution. - 1999. - Vol. 16. - P. 37-48.
9. Espineira M., Gonzalez-Lavin N., Vieites J.M., Santaclara F.J. Development of a method for the genetic identification of flatfish species on the basis of mitochondrial DNA sequences // J. of Agricultural and Food Chemistry. - 2008. - Vol. 56. - P. 8954-8961.
10. Grant W.S., Bakkala R., Utter F.M. et al. Biochemical genetic population structure of yellow sole, Limanda aspera, of the North Pacific Ocean and Bering Sea // Fish. Bull. - 1983. - Vol. 81, № 4. - P. 667-677.
11. Irwin D.M., Kocher T.D., Wilson A.C. Evolution of the cytochrome b gene of mammals // J. of Molecular Evolution. - 1991. - Vol. 32. - P. 128-144.
12. Kartavtsev Y.P., Park T.J., Vinnikov K.A. et al. Cytochrome b (Cyt b) gene sequence analysis in six flatfish species (Teleostei, Pleuronectidae), with phylogenetic and taxonomic insights // Mar. Biol. - 2007. - Vol. 152. - P. 757-773.
13. Kijewska A., Burzynski A., Wenne R. Molecular identification of European flounder (Platichthys flesus) and its hybrids with European plaice (Pleuronectes platessa) // ICES J. Mar. Sci. - 2009. - Vol. 66. - P. 902-906.
14. Librado P., Rozas J. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data // Bioinformatics. - 2009. - Vol. 25, № 11. - P. 1451-1452.
15. Mjelle K.A., Karlsen B.O., Jorgensen T.E. et al. Halibut mitochondrial genomes contain extensive heteroplasmic tandem repeat arrays involved in DNA recombination // BMC Genomics. - 2008. - Vol. 9, № 10. - P. 1-10.
16. Nei M., Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics. - Oxford : Oxford Univ. Press, 2000. - 333 p.
17. Nielsen J.L., Graziano S.L., Seitz A.C. Fine-scale population genetic structure in Alaskan Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis) // Conservation Genetics. - 2010. - Vol. 11, № 3. - P. 999-1012.
18. Sevilla R.G., Diez A., Noren M. et al. Primers and polymerase chain reaction conditions for DNA barcoding teleost fish based on the mitochondrial cytochrome b and nuclear rhodopsine genes // Mol. Ecol. Notes. - 2007. - Vol. 7. - P. 730-734.
19. Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetic Analysis version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - P. 2725-2729.
20. Was A., Gosling E., Hoarau G. Microsatellite analysis of plaice (Pleuronectes platessa L.) in the NE Atlantic: weak genetic structuring in a milieu of high gene flow // Mar. Biol. - 2010. - Vol. 157, № 3. - P. 447-462.
Рецензия
Для цитирования:
Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. Генетическая дифференциация желтоперой камбалы ( Limanda aspera) Тауйской губы, выявленная по нуклеотидным последовательностям фрагмента гена цитохрома b мтДНК. Известия ТИНРО. 2015;183(4):89-96. https://doi.org/10.26428/1606-9919-2015-183-89-96
For citation:
Pustovoit S.P., Yusupov R.R. Genetic differentiation of yellowfin sole ( Limanda aspera) from the Tauiskaya Guba Bay revealed on nucleotide sequences in fragment of the gene of cytochrome b mtDNA. Izvestiya TINRO. 2015;183(4):89-96. (In Russ.) https://doi.org/10.26428/1606-9919-2015-183-89-96
Просмотров: 417
Послать статью по эл. почте 